菏泽市妇幼保健院儿科是临床重点科室之一，现有医护人员35人，其中主任医师3人，副主任医师1人，主治医师4人，住院医师10人，硕士研究生4人。儿科开放床位60张，设有普通儿科病房、普通新生儿病房、新生儿重症监护病房，配备有国家标准化十万级层流新生儿病房、德国进口新生儿专用常频、高频和无创呼吸机、美国GE长颈鹿牌辐射抢救台、美国GE长颈鹿牌暖箱、美国GE血气分析仪GEM4000、意大利进口可移动床旁X拍片机、床旁B超、双面LED蓝光箱、多参数心电及血氧监护仪、新生儿除颤仪、鲁西南地区第一家新生儿急救转运系统等先进仪器设备。我院儿科经过几代人的奋斗和70年余年的发展积淀，对新生儿疾病、儿童感染、消化、泌尿、神经、心血管、血液内分泌疾病等疾病诊治积累了丰富的临床经验，熟练施行无创、常频、高频等呼吸机辅助通气，熟练操作气管插管、脐静脉脐动脉置管、经周围静脉中心静脉置管，形成UVC、UAC→PICC→周围静脉穿刺的一体化静脉输液，极大地减轻了新生儿静脉穿刺痛苦，熟练完成新生儿换血疗法，可以杜绝Rh溶血导致的新生儿脑部损害。另外，伴随着我院血液串联质谱等先进技术在我市率先开展，在儿童遗传代谢性疾病如甲基丙二酸血症、原发性肉碱缺乏症、希特林蛋白缺乏症、同型半胱氨酸血症等罕见病的诊治水平在我市独树一帜。尤其引以为傲的是我院新生儿急救转运系统的建立和投入运营，为我市各家医院成功转运了大量极其危重新生儿，在我院、我市、我省及北京上海得到及时治疗，受到了患儿家长的高度赞扬。