巨野县人民医院儿科为市级重点专科，分为儿一科、儿二科和新生儿科3个病区。儿科现有医疗专业技术人员34名（研究生8名），其中主任医师5名，副主任医师6名，主治医师15名，住院医师8名。科室功能完备、设施齐全，拥有先进的仪器设备，如新生儿呼吸机、CPAP无创呼吸机、心电监护仪、婴儿辐射台、婴儿培养箱、蓝光治疗仪、经皮胆红素分析仪、全自动血气分析仪。儿内科开放床位132张，其中NICU20张，PICU2张。2018年，"巨野县新生儿急危重症救治中心"，通过菏泽市卫健委验收。近几年来，儿内科业务范围不断扩大，对各系统常见多发病病的诊治取得了丰富的经验，在肺炎合并心力衰竭、呼吸衰竭、重症脑炎、消化道出血、各类休克、脓毒症、惊厥持续状态、激素耐药或依赖性肾病综合征、新生儿呼吸窘迫综合征、新生儿各种溶血病、早产儿等急危重症的应急及救治方面整体技术水平明显提高，在技术创新方面，先后开展了脐静脉、改良脐动静脉、外周动静脉同步换血术，nCPAP联合肺泡表面活性物质治疗NRDS，新生儿支气管灌洗术，支气管镜技术，儿童哮喘的防治等诊疗技术。获菏泽市科研成果三等奖9项，先后发表论文50余篇，市职工创新成果三等奖1项。参与主编著书12部，国家实用新型专利17项。儿科全体医护人员将树立现代化科室发展新理念，紧贴国内儿童保健的现实需求，为年轻父母育儿提供全面、先进、优质的保健指导与服务，让每一位儿童都能在身心健康、充满关爱的环境中成长。