我院儿科系菏泽市重点临床专科。该科始建于1962年，科室设在医院北院区妇儿医疗部。儿科医护人员有主任医师、副主任医师、主治医师、住院医师，其中有研究生、在读研究生。儿科病房设普通病区和新生儿重症监护病房。科室医疗设备有美国Necolet视频脑电图仪，美国鸟牌婴儿人工呼吸机，婴儿高压氧舱，床边心电监护仪，闭式婴儿暖箱，婴儿暖床，微量输液泵，经皮胆红素测定仪，开放式辐射，CPAP，空气净化仪，微量血糖测试仪。科室有以下几个专业：小儿神经专业，新生儿专业，小儿呼吸专业、心血管专业、血液专业、肾病专业、遗传专业等，其中小儿神经及新生儿专业为儿科重点专业。1.小儿神经专业：开展了视频脑电诊断，多发性神经根炎伴呼吸机麻痹的人工呼吸机治疗。在小儿癫痫的治疗，小儿脑瘫的诊治，小儿神经病的诊断，重症肌无力的诊治，重症脑炎的诊治方面有经验。2.新生儿专业：开展了早产儿综合治疗，肺表面活性物质及人工呼吸机治疗新生儿肺透明膜病等。3.呼吸专业：开展了特布他林联合布地奈德雾化吸入治疗毛细支气管炎，在控制感染、给氧、纠酸、补液的同时，加用特布他林及布地奈德雾化吸入。新生儿病区（NICU）新生儿病区位于医院北院区妇儿部。主要收治自出生至生后28天的新生儿，开展危重新生儿的抢救及监护治疗工作。科室拥有专业医护人员，科室配备了婴儿培育箱、多功能心电监护仪、进口新生儿呼吸机、新生儿辐射式抢救台、气管插管及复苏球囊、蓝光治疗箱、微量血糖分析仪、经皮胆红素测定仪、微量注射泵等医疗设备。新生儿监护病房可收治围产期窒息缺氧、新生儿黄疸、早产儿、胎粪吸入综合症、新生儿呼吸窘迫综合症、新生儿肺炎、多脏器功能损伤等急危重患儿的新生儿。开展了持续气道正压通气、常规机械通气、胃肠外营养及肺表面活性物质气道内注入救治新生儿呼吸窘迫综合症。开展了新生儿PICC穿刺技术。应用以责任制优质化护理为中心的护理模式。开展了机械通气治疗新生儿、早产儿呼吸衰竭；肺泡表面活性物质治疗新生儿呼吸窘迫综合征、胎粪吸入综合征；危重新生儿的静脉营养技术。对出院的早产儿及危重新生儿进行随访，监测生长发育情况并给予康复指导。