神经内科成立于1987年，2019年被山东省卫健委批准为"山东省精品特色专科〈免疫性周围神经病诊疗专科〉"、2020年被山东省卫健委批准为"临床重点专科"、2020年被评为"山东省护理学会神经科护理专科护士临床教学基地"。历经三十余年的积累，铸就了一支业务精湛、团结协作、积极进取的集医疗、教学和科研为一体的团队，在鲁西南地区神经病学临床工作及基础研究中形成了自己的专业特色。2011年聘请留美学者郝延磊教授为神经内科学科带头人，为科室带来美国的先进诊疗技术及管理理念。现神经内科设有六个病区，医院本部五个，太白湖院区一个，开放床位共235张。神经内二科开放正式床位41张，拥有医生11名，其中主任医师3名、副主任医师2名、主治医师4名；护士19名，其中主任护师1名、主管护师11名、护师3名。科室开展了脑和脊髓血管造影、颅内外脑动脉支架置入术、颅内各部位动脉瘤栓塞术、颅内静脉窦血栓形成取栓术、脑梗死急诊动脉取栓术等各种神经介入疑难复杂手术，建立吉兰-巴雷综合征动物模型、开展新药动物实验、神经节苷脂抗体测定、血浆置换治疗以及国际交流合作，建立了记忆障碍门诊、头晕门诊、神经免疫专科门诊、神经介入门诊、脑卒中预防门诊，开展了各种神经心理量表测定、耳石复位、肌肉活检及神经电生理检查。目前科室已主持或参与完成国家自然科学基金、山东省自然科学基金、济宁市科技局等各级科研课题20余项，在研课题10余项。