肿瘤科成立于1998年，目前是国家住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验基地、临床药师培训基地，山东省临床重点专科、山东省癌痛规范化示范病房及诊疗病房、山东省微创介入治疗副理事单位、山东省区域乳腺中心联盟分中心，同时也是济宁市肿瘤会诊中心、肿瘤专科联盟牵头单位、肿瘤专业质量控制中心主任单位。目前拥有174张病房床位和54张日间治疗床位，科室由5个亚专业病区、肿瘤日间治疗中心和放疗室组成。目前医疗人员41人，其中主任医师7人，副主任医师13人，主治医师19人，博士研究生5人，硕士研究生18人；护理人员56人，其中主任护师1人、副主任护师2人、主管护师29人；放疗室18人，其中主任医师1人，副主任技师1人，物理师7人，技师9人，护士1人。科室开展药物临床试验26项，结题5项，在研21项，待启动8项。定期组织线上和线下MDT，开设肿瘤门诊、乳甲肿瘤内科门诊、PICC门诊，为肿瘤患者提供规范化放疗、化疗、微创介入、靶向治疗、免疫治疗、内分泌治疗等综合治疗。目前获得国家青年科学基金科研项目一项、山东省自然科学基金一项、山东省卫生健康委员会课题一项、山东省卫生厅面上项目一项、济宁市科技局面上项目两项。科室拥有现代化的检查治疗仪器设备，配备医科达VersaHD直线加速器1台，瓦里安IX直线加速器1台，飞利浦Brilliance大孔径CT模拟定位机1台，瓦里安Acuity数字模拟机1台，微波消融治疗机2台，碘125粒子治疗系统等微创治疗设备。