儿科是济宁医学院附属医院的重点临床科室之一，是集医疗、教学、科研、保健、康复于一体的大型临床科室，一贯秉承"一切为了病人"的服务理念，全方位为患儿服务，一直以来在鲁西南儿科界享有盛誉。我院2011.10.19正式启用妇儿大楼，目前儿科开放床位479张，分为新生儿重症监护病区（NICU）、儿童重症监护病区（PICU）、新生儿病区、非感染病区（包括儿童血液病房、肾脏病房、内分泌病房、风湿免疫病房）、神经系统疾病病区、消化系统疾病病区、呼吸系统疾病病区、儿童康复病区、小儿先天性心脏病介入治疗病区，共9个病区，12个临床专业。现有医生83名，其中主任、副主任医师31人，主治医师28人，博士、硕士研究生49人。最大日门诊量1200人次，平均700余人次，年门诊量25万人次，年出院病人近2万人次。系山东省住院医师规范化培训基地。承担医学院医疗系、护理系，本、专科的中英文理论课教学和临床带教实习、临床技能培训工作，承担"儿科诊疗新进展"等多项省市级继续医学教育项目。2010年11月17日与北京军区总医院八一儿童医院签约成为技术合作医院，为疑难重症患儿提供了全新的治疗手段，并为疑难、危重症患儿的转运开辟了绿色通道。