济宁医学院附属医院工会是医院职工自愿结合的群众组织。在院党委和上级工会的领导下，紧紧围绕医院中心工作，根据工会章程，认真履行工会四项基本职能，维护职工权益，积极开展民主管理，充分调动职工积极性，增强医院凝聚力。组织开展各项劳动竞赛和职工文化体育活动。关心职工生活，为职工办实事、做好事。现工会委员会有11人组成。有六个分工会，行政分会、门诊分会、内科一分会、内科二分会、外科一分会、外科二分会；下设工会经费审查小组、女职工委员会。自建会以来先后荣获山东省卫生系统"巾帼文明岗"、全省卫生系统"工会工作先进单位"、山东省"优秀职工之家"、济宁市"第五届职工职业道德先进集体"称号、女工委员会被评为济宁市"先进女职工组织"。省卫生系统"巾帼文明岗"、全省卫生系统"工会工作先进单位"、山东省"优秀职工之家"、济宁市"第五届职工职业道德先进集体"称号、女工委员会被评为济宁市"先进女职工组织"。