为进一步加强人口和计划生育工作，严格终止妊娠管理，禁止选择性别终止妊娠，有效遏制全市出生人口性别比升高势头，降低出生缺陷，经市政府同意，2009年12月17日由原市人口计生委和市原卫生局两部门批准成立市终止妊娠鉴定检测中心，中心设在济宁市妇幼保健计划生育服务中心，承担两项职能，一是为孕妇提供产前筛查出具医学需要终止妊娠建议书；二是对妊娠14周以上的孕妇出现流产、早产、死胎的，是否涉嫌选择性别终止妊娠进行检测。由我院和市卫计委妇幼科共同承担此项工作。是全市唯一具备出具需要终止妊娠医学建议和选择性别终止妊娠报告资格的机构。市终止妊娠鉴定检测中心具有独立检测实验室，配备高效液相色谱仪、飞利浦IU22四维彩超、美国华莱士光学电子阴道镜。8年来共受理终止妊娠19967人，为打击"两非"提供了科学依据。成为综合治理性别比失调的重要手段。2011年"中心"与济宁医学院合作进行遗传病、出生缺陷研究，建立了标本室，在省人口计生委科研立项3项。"中心"成立以来，省市领导多次到"中心"视察，对"中心"工作给予了高度评价和充分肯定，认为济宁市卫计委以"优生优育"、提高出生人口素质为结合点，优势互补，顾大局、重实效，创新性地开展工作，为济宁市控制出生人口性别比例失调、降低出生缺陷及有效打击和遏制了"两非"作出了积极贡献。