2006年成立输血科，前身为1958年建院时的血库。现有工作人员12名，医师系列5人、技师系列7人;其中高级职称2名，研究生学历8人。是"北京市临床输血质量改进和控制中心"副主任委员单位和北京市朝阳区卫生局"朝阳区临床输血质量改进和控制中心"主任委员单位;卫生部临床输血相容性检测室间质评五家网络实验室之一。作为"北京市临床输血技术人员培训基地"，承担着本院、北京市及外埠各医疗机构临床输血技术人员的培训教学工作。科室具备较为完善的临床输血质量管理文件，初步建立了质量管理体系，为临床安全输血提供了有效的保障。年度临床用血量达2万余单位，疑难配血百余人次。自2003年参加北京市、卫生部临床输血相容性检测室间质评，成绩均优秀;2010年起参加美国病理家协会(CAP)"TransfusionMedicine"室间质评，成绩均为"Good"。2011年12月成为首家通过北京市卫生局"增设输血科诊疗科目"注册验收的医院。同年在我院输血科的倡导下创建了北京市"北京临床输血青年沙龙"，每季度一期进行输血学术交流活动，促进青年人才的培养和成长，为输血行业的发展注入新鲜的血液和活力。2008年主持并完成卫生部"肿瘤患者临床用血指南及评价方法"课题;参与2010年度卫生部卫生行业科研专项项目"临床有效输血及血液风险控制技术应用研究与推广"课题;与卫生部北京医院合作申请2012年"首都卫生发展科研专项-北京市临床输血管理指南的建立"课题。参与由卫生部政策法规司"输血相容性检测"国家技术标准的制定(编号20121003)。已在国内核心期刊发表学术论文数十篇。