应急总医院消化内科由门诊、病房及内镜中心组成。目前科内人员中有主任医师2名，副主任医师3名，博士6名。现有床位20张，可收治各种消化系统常见疾病及疑难杂症，在急慢性消化道出血、急性胰腺炎、肝硬化、胆道结石、梗阻、消化道梗阻、消化道息肉、癌前病变、早期病变及消化系肿瘤初筛、介入治疗及终末期维持治疗方面，均有特色。特别是在经皮经肝胆道穿刺引流及成形、经皮经肝胆囊穿刺、肝穿刺活检、肝动脉栓塞化疗等方面有丰富的操作经验。内镜中心配有先进的电子胃镜、电子放大胃镜、电子结肠镜、电子十二指肠镜、超声内镜、胶囊内镜等设备，可进行常规及无痛内镜检查及内镜下微创手术，包括1.消化道出血急诊内镜检查及治疗;2.内镜下取各种异物;3.食道、胃肠及胆管狭窄支架置入术;4.食管及胃肠道早癌内镜下早期诊断和内镜下切除术(EMR和ESD术)5.内镜下胆总管结石取石术(ERCP)6.内镜下经皮胃造瘘术(PEG)7.内镜下胃石碎石术。