呼吸内科是国家安监总局确定的重点专科，是集医疗、教学、科研为一体，对门诊病房、支气管镜室、肺功能室统一管理的独立临床科室，为协和医科大学住院医师见习基地、国家药物临床实验基地。在肺癌介入治疗、支气管镜介入治疗方面处于国内领先水平。现有医师中主任医师4名，副主任医师3名，主治医师3名，博士3名，硕士5名。呼吸内科现有床位38张，拥有呼吸内镜中心、肺功能室、中心实验室及呼吸机、监护仪等先进的仪器设备。年收治病人近千余人次，年门诊量近万余人次。2014年7月在京城大医院中率先开通呼吸道梗阻诊疗“绿色通道”，承诺对因肿瘤引起的气道梗阻，气管切开、插管、支架或外伤引起的气道再狭窄，气管结核引起的气道狭窄、异物误吸引起的气道梗阻的本市或外地患者，实行24小时接诊，力争在住院半小时内得到有效治疗。呼吸内科诊治各种呼吸系统疾病，在各种原因所致气管狭窄、职业相关肺疾病、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、间质性肺疾病等诊治上，具有成熟的诊疗策略和有效的治疗方法。