应急总医院针灸科以中医针灸临床医疗为主，兼顾科研、教学三位一体有机结合。现有主任医师2人，副主任医师4人，博士生导师1人，博士2人，博士后1人，硕士4人。承担并完成了世界卫生组织课题《针灸优势病症研究》，成果被编入世界卫生组织正式文件，参加国家科技部973课题《穴位效应机理研究》和《基于临床的针刺麻醉机理研究》的研究。获得部级科技成果二等奖一项，三等奖2项。除了培养博士硕士研究生外，还承担了世界针灸联合会委托的国际留学生的带教任务。科室以传统针灸为主要治疗手段，擅长治疗内科病，外科、妇科、小儿科、皮科病及五官科等科慢性病、常见病、多发病。