甲状腺、乳腺外科是集临床、科教研为一体的临床科室。配备有美国强生公司乳腺麦默通（Mammotome）微创活检系统、乳腺导管内视镜、乳腺三才治疗仪、带计算机定位穿刺数字化乳腺X光机（钼靶机）、高清腔镜系统及超声刀、乳腺高分辨彩色B超、CT及磁共振等先进医疗设备。专科收治各种甲状腺、乳腺疾病患者。开展甲状旁腺切除并自体移植治疗肾衰继发甲状旁腺功能亢进症。中西医结合治疗浆细胞性乳腺炎取得良好效果，达广西区内领先水平。开展各种乳腺癌保乳及根治术、乳房再造手术，乳腺癌规范化疗及中医治疗取得良好效果。中医内治外治治疗乳腺增生形成特色，治疗效果好。开展腔镜治疗甲状腺肿瘤手术，术后几乎不留疤痕，美容效果好。科室目前主持广西科技攻关课题、广西卫计委重点课题等科研课题。