广西壮族自治区妇幼保健院病理科创建于1965年，目前设于新阳院区，经过多年的建设和发展，现已成为一所集医疗、教学、科研为一体的现代化病理实验室。病理科设有细胞室、免疫组化室、切片室、染色室、诊断室等部门。科室现有医务人员17人：医生组9人，其中高级职称1人，中级职称2人；技术组8人，其中高级职称1人，中级职称2人。特聘请广西著名病理专家，定期指导病理诊断工作。同时我院病理科与广西壮族自治区人民医院病理科签订了病理检查合作协议，与广西医科大学第一附属医院病理科签订了专科联盟协议，以持续提升病理诊断技术水平。​科室还承担教学和科研工作，作为广西宫颈疾病防治中心学员的进修培训基地。同时作为右江民族医学院、桂林医学院及广西卫生职业技术学院等重要医学高校的临床教学基地，每年承接医学专业进修实习的带教工作。