盱眙县人民医院病理诊断中心位于新院区门诊部2楼，总面积达700多平方米，现有诊断医师6人，技师8人。其中副高级职称1人，中级职称2人。中心设有组织病理学诊断室、细胞病理学诊断室、病理读片和会诊室、免疫组化和特染室、病理技术室、病理取材室、冰冻切片室、标本陈列室、肿瘤生物样本资源库、学术活动室、信息管理系统室、病理档案室、试剂储存室等。中心有轮转式切片机、光学显微镜等常规仪器。近年来，更新添置了一批先进的仪器设备，如进口德国徕卡冷冻切片机、超声波人体组织快速处理仪、全自动组织脱水机、染色机、封片机、打号机、组织包埋机、组织漂烘仪、病理图文工作站等。多年来，中心一直承担着全县各级医疗卫生单位的病理检查工作，为全县肿瘤病普查和研究做出了积极贡献。年常规病理检查1万多例，细胞学检查1万余例。中心除开展常规病理检查外，还先后开展了术中快速石蜡切片诊断、组织化学染色、免疫组织化学染色、病理图文报告等项目，在普通外科、泌尿外科、妇产科、耳鼻喉科疾病以及消化道肿瘤、骨肿瘤和皮肤肿瘤诊断等方面都积累了丰富的诊断经验。