盱眙县人民医院中心实验室暨临床科研中心于2016年10月成立，现为淮安市消化道肿瘤精准筛查与诊疗重点实验室、盱眙县最早开展新冠核酸检测工作的基因扩增实验室。实验室下设分子生物学实验室、蛋白生物学实验室、细胞培养室、实验动物房和临床基因扩增实验室，是集基础科研、临床检测为一体的综合性科室。现有外聘专家1人，固定工作人员7人（其中博士1人，硕士4人）。目前实验室拥有流式细胞仪、实时荧光定量PCR仪、倒置荧光显微镜、倒置显微镜、凝胶成像系统、超微量分光光度计、台式高速冷冻离心机、细胞CO2培养箱、细胞超声破碎仪、超低温冰箱等40多台（套）先进仪器设备。中心实验室目前主要开展PCR相关的临床基因检测项目和基础科研项目，同时为全院科研课题提供试验场地、仪器设备、技术支持与培训等。