南通市第三人民医院眼科成立于2001年，目前拥有专科医生3人，其中高级职称1人，中级职称2人，具有硕士学历1人。拥有眼科专职技师1人，专科护士1人。科室2005年开设了白内障诊治专科，在全市率先开展白内障超声乳化术，为广大白内障患者带来了福音。科室还常规开展翼状胬肉切除联合角膜缘干细胞移植术、睑内翻矫正术等。科室拥有光学相干断层成像系统（OCT）、生物测量仪、眼底照相机、角膜地形图仪、角膜内皮镜、眼科A/B超、综合验光仪、非接触式眼压计、蔡司手术显微镜等国内一流设备。建科近20年来，科室在省级以上期刊发表论文20余篇。