东直门医院通州院区神经外科于2013年12月3日成立。神经外科配备床位37张，医护人员24人。拥有德国莱卡荧光造手术显微镜、神经内镜、GE数字剪影血管造影机、蛇牌动力系统、双极电凝及立体定向系统，具备开展神经外科各种开颅及介入手术的硬件设备及人才梯队。拥有神经重症监护室NICU床位8张，引进德国Drager床旁监护系统，呼吸机，冰毯机、移动式X光机等多种设备。目前开设神经外科门急诊，工作日均有专家出诊。