成立于上世纪50年代，为医院重点科室，技术力量雄厚，拥有一批学术根底扎实、技术全、临床经验丰富的专业化医疗队伍。能常规开展全膀胱切除术、根治性前列腺癌切除术、根治性肾癌切除术、腹膜后巨大肿瘤摘除术等及一系列腔道泌尿外科微创手术，男科假体植入术手术量全国前三。已形成了具有自身特色和学术风格的专业，在泌尿系肿瘤、结石、男科学、前列腺疾病的基础和临床方面具有一定知名度，尤其是在微创泌尿外科、腔内泌尿外科、尿流动力学方面更是有着独到优势。近年来，随着二院"接轨上海"工作的深入开展，医院泌尿外科也与上海多家医院泌尿科开展交流合作，开通上海名家的预约绿色通道，不定期邀请重量级专家来院会诊、手术。