呼吸内科为南通市临床重点建设专科，现有医师24人，其中博士5人(含博士在读)，硕士9人，高级以上职称人员14人，特聘专家1名(谭清和主任医师)。科室医疗辐射面广，收治的病人中70%来自南通地区，25%来自南通周边地区,5%来自外省市。呼吸内科主要收治呼吸系统肿瘤患者、部分危重或诊断不明的呼吸系统疾病患者，根据病人的体质、病理的类型、肿瘤基因表达的不同实行规范化、个体化治疗，分别采取化疗、化放疗同步、序贯化放疗、分子靶向治疗、免疫治疗以及最佳支持治疗。科室对恶性心包积液、恶性胸水患者采用的细导管引流术，能迅速缓解病人症状，取得良好的治疗效果。科室的气管镜室拥有潘太克斯电子气管镜、EBUS、奥林巴斯电子气管镜、奥林巴斯超细电子纤维支气管镜等先进仪器设备，熟练开展对呼吸系统疾病的诊断和鉴别诊断，通过气管支架植入术治疗各种原因引起的气管、支气管狭窄，同时还能开展经气管镜肺活检术、经气管镜纵隔淋巴结穿刺活检术以及肺冲洗、灌洗术、微波治疗、射频治疗、套扎切除肿瘤等先进诊治技术。科室重视培养呼吸肿瘤专科人才，数十年来培养了来自新疆等外省市及周边县级医院肿瘤专科进修医生数十名，承担南通地区肿瘤科规范化诊疗的培训任务，是中国医药教育协会江苏省肺癌规范化诊治南通市示范中心。2013年，科室获得《药物临床试验机构资格认定证书》，近年来参加了由国家卫健委、北上广大型医院、江苏省肿瘤医院组织的十几种新药、新的联合治疗、新的仪器检查设备的临床试验，采用的肺癌化疗、靶向、免疫等综合治疗手段均与国内先进三甲医院接轨。