儿童中心是医院近年强力打造的科室，也是提升最快的科室之一，着力全面提高医、教、研、防水平，被授予北京市重点专科培育科室，指定为通州区危重新生儿转诊救治中心，建立了潞河-京津冀儿科专科联盟，拥有首都医科大学硕士生导师，是首都医科大学儿科学硕士培养点。科室共有21名医生，其中博士1人，硕士12人，在读硕士2人;护士50多人，定期派骨干人员外出培训。年门诊量14万余人次。除了普通门急诊、专家门诊外，还开设了3个特色专科门诊，过敏反应和哮喘门诊被授予北京市标准化哮喘门诊;高危儿、新生儿随访门诊为婴儿生长和神经发育做评估指导;儿童营养与代谢障碍门诊为儿科、中医科、营养科、内分泌科多学科联合门诊，目前正开展儿童肥胖管理项目，与学校共同为肥胖儿童做健康减肥管理。儿童中心营养代谢门诊是一个多中心门诊，由儿科、营养科、中医科共同诊疗，主要为营养代谢异常的孩子开设，包括儿童肥胖症、消瘦、矮小症、性早熟等营养不足和营养过剩引起的一系列疾病。矿物质、微量元素缺乏，身高、体重生长异常，食欲不振、厌食等问题要及时就诊，早日发现问题，早日恢复健康，以免长期异常导致合并症，影响更多的组织器官损伤。病房床位60张，包括新生儿和普通儿科病床，开展了高级生命支持技术，儿童支气管镜诊疗技术，NICU目前收治最小早产新生儿25+周，最小体重为750g。出院后早产儿群管理300多人，定期到随访门诊做评估指导。除了常规医疗工作，还承担首都医科大学本、专科生以及成人教育的理论课与实践教学任务，承担全科医师和3+2规范化培训儿科学部分的教学工作。3年来承担科研课题8项，发表论文20余篇，其中SCI收录6篇。编写教材和专业相关书籍6部。组织区级及市级继续教育项目10余项。儿童中心全体医护人员将竭诚为城市副中心的医疗卫生事业发展尽最大的努力。