我院运动医学科是盐城市医学会专科分会的主委单位。运动医学的相关工作起步于2003年，2003年北院区成立盐城市第三人民医院关节镜外科特色专业诊疗组，负责床位10张，2014年成立运动医学科，病区分布在南、北院区，病床数40张。目前有主任（副）医师5人，主治医师2人，住院医师2人。其中博士1人，硕士8人。硕士研究生导师2人。盐城市医学青年人才3人。多人在中华医学会及省、市医学会及医师协会担任委员职务。目前配备4套关节镜器械。开展手术涉及肩关节、肘关节、腕关节、髋关节、膝关节、踝关节等。年手术量500台左右，多项技术填补盐城市空白，处于省内领先水平。在膝关节镜方面，我科是盐城地区乃至苏北地区最早开展关节镜诊疗的专科。目前常规独立开展膝关节镜下半月板手术、软骨移植手术、膝关节镜下髌骨三联术、前后交叉韧带重建手术及膝关节镜辅助下关节粘连松解术、胫骨平台骨折的关节镜辅助治疗、膝关节周围截骨手术的保膝治疗等。在肩关节镜方面，我科学术骨干多次于美国、德国、韩国、上海市第六人民医院、北京积水潭医院、北医三院、南京鼓楼医院等国内外知名运动医学专科学习。目前常规独立开展关节镜下肩峰成型术、粘连松解术、全镜下肩袖修补术、肩关节不稳的手术治疗等。在髋、踝、肘、腕关节镜方面，常规独立开展踝关节镜下踝关节撞击综合症手术、踝关节韧带重建术、踝关节镜下踝关节融合术、踝关节镜下剥脱性软骨炎软骨修复术等。肘关节镜下顽固性网球肘的治疗、腕关节镜下TFCC修复术、髋关节镜下游离体取出、髋关节镜下股髋关节撞击症的微创治疗等。近年来，运动医学科承担和参与的科研项目包括省级课题3项，市级课题和合作课题10余项，发表SCI、中华、核心期刊论文30余篇。获得省卫计委新技术引进将二等奖、市科技进步二等奖、市医学新技术引进一等奖等多个奖项。