肿瘤科（含放疗科）建科于1993年，为国家中医药管理局"十二五"重点建设项目单位、江苏省重点专科、江苏省中西医结合结直肠肿瘤诊疗中心。现有高级职称8名，中级职称7名，住院医师3名；其中博士5名，硕士10名，2017年培养1名博士后进站，放疗医师4名，物理师3名，技师4名。科室团队是一个团结、奋进、持续学习的团队。经过多年的科学管理、储备，已发展成为集肿瘤化疗、放射治疗、分子靶向治疗、免疫生物治疗、肿瘤微创介入、中医中药治疗为一体的综合诊治专业。在肿瘤专业学科带头人、硕士生导师方明治教授的带领下，近年来各亚专业发展突飞猛进、人才梯队构建逐步成熟，专业技术日益精湛丰富。同时方明治主任作为南京市名中医，在肿瘤的中医中药治疗方面有自己独到见解，享有很高的声望。肿瘤科（含放疗科）主要开展消化道肿瘤、肺癌、乳腺癌等多种实体肿瘤及淋巴瘤的诊治，尤其开展了疑难、危重、复杂病例的诊治。设有胸部肿瘤、消化道肿瘤、血液系统肿瘤、放射治疗、肿瘤微创介入治疗等亚专业方向。