神经内科学科建设持续发力，一直保持着强劲的发展势头。该科是省内较早开展微创颅内血肿清除治疗脑出血科室之一，2002年以来一直被国家卫健委指定为"全国微创协作医院"，2004年在省内同级医院率先开展脑血管DSA术及支架植入术。成为首都医科大学附属北京天坛医院神经系统疾病专科联盟成员单位及神经介入联盟成员单位，获"江苏省青年文明号"等荣誉称号。现拥有专科医生46名，其中主任医师4名，副主任医师14名，主治医师7名；博士5名，硕士34名，博士在读2名。南京医科大学研究生导师1名，南京医科大学副教授5名。设有四个病区，床位172张，其中包括8张NICU床位，配有先进的NICU监护、脑血管DSA等全套设备及各类专科设备。常规开展神经系统重危、疑难病例的救治，开展中枢神经系统感染、神经系统免疫疾病、运动障碍、神经变性、周围神经病、癫痫、痴呆等疾病诊治及神经康复等；开展肌电图、脑电图、视频眼震、颈部血管彩超等电生理检查；开设眩晕、癫痫、卒中、睡眠障碍、神经心理等专病门诊。特色治疗项目主要有：脑梗死超早期动静脉溶栓治疗及急性脑梗死动脉内取栓术、全脑血管造影及支架植入治疗、脑动脉瘤介入栓塞治疗、手法复位治疗位置性眩晕、Ａ-型肉毒毒素治疗肌张力障碍和难治性偏头痛、亚低温治疗重症脑卒中、脑出血微创碎吸引流术及焦虑、失眠等神经症诊治和心理咨询等。脑卒中绿色通道"时间就是大脑"。作为南京市卒中救治中心单位，医院卒中绿色通道高效畅通，确保卒中患者得到及时救治，有效降低了死亡率和致残率。神经内科还专门安排一名医生24小时负责急诊卒中的会诊、协调。卒中绿色通道开通后，多数患者在到院30分钟即完成了检验和影像检查，并能及时开展静脉、动脉溶栓和器械取栓桥接治疗。