儿科近年来发展势头较为强劲，学科体系逐步完备，医疗技术水平持续提升，现已拥有普儿科、新生儿科及部分儿外诊疗功能，开设三个病区，总床位数104张，能够较好地满足江宁及周边地区患儿的就医需求。普儿科普儿科现开设两个病区、床位64张。拥有专科医生41名，其中主任医师4人，副主任医师7名，主治医师14名；博士研究生1名，硕士研究生16名；教授1名，副教授3名。儿科各专科设置较为齐全，儿科门诊开设专家门诊、外聘专家门诊、普通门诊，专科门诊主要有哮喘专科、手足口病专科、儿童营养代谢专科、小儿神经内科、儿童血液专科、儿童消化科、儿童保健专科、儿童内分泌专科、儿童骨科、儿童发育行为专科。拥有呼吸机、肺功能仪、呼气末一氧化碳测定仪、多功能监护仪、输液泵、血气生化分析仪、超声脉冲电导治疗仪、压缩式雾化器等专科设备。可开展机械辅助排痰、雾化吸入、肺功能检测、一氧化氮呼出气检测、儿童发育行为评估及脑电图、纤维支气管镜、胃镜检查等。对小儿呼吸、消化、神经、风湿免疫、肾脏、内分泌、骨科、发育行为及儿童营养代谢疾病等各系统疾病的诊治具有丰富的临床经验及理论研究。特别是对各种类型肺炎、哮喘、脱水、惊厥、休克、中毒等急重症的诊治技术全面，具有较强的救治能力。在对外合作方面，儿科是南京市儿童医院医联体合作单位，对新疆特克斯县人民医院及县妇幼保健院、陕西省洛南县人民医院、江宁区湖熟、麒麟街道社区卫生服务中心进行技术支持。