南京医科大学附属逸夫医院药学部是集药学服务、科研、教学为一体的综合性科室，秉承"一切以患者为中心"的宗旨，服务于临床医疗。目前承担全院中西药品的采购、供应、临床调剂等工作，为药品进入医院提供全程质量管理，同时进行临床药学、药物试验、药学情报等领域的分析、统计、研究工作。药学部现有三个中心——药品调剂中心、药品营运中心及静脉用药集中调配中心，设有门诊药房、住院药房、急诊药房、草药房、手麻药房、儿科药房、静脉配置中心、临床药学室、药库等部门。目前药学部有硕士及以上学历11人，临床药师8人，承担药学专业本科生的教学实习和进修生的培训任务。