南京医科大学第二附属医院呼吸与危重症医学科是江苏省临床重点专科，国际国家临床药理研究基地、呼吸病学博士学位授权点。下设3个病区，拥有床位81张（含呼吸重症监护室床位5张），年门诊量2.5万人次，年住院病人2200余人次。现有医护人员51人，其中教授、主任医师4人，副教授、副主任医师9人，讲师、主治医师8人。博士研究生导师1名，硕士研究生导师3名、博士5名，硕士9名。学科囊括下呼吸道感染、慢性气道炎症、肺癌及介入、睡眠相关呼吸疾病及间质性肺病等多个亚专科，并具备相应的人才储备。专业设备先进齐全，拥有日本Olympus电子支气管镜及超声引导支气管镜（E-BUS）、ERBEVIO200D呼吸内镜电外科工作站、ERBOKRYOCA多功能冷冻治疗仪、德国JAEGER全自动肺功能测定仪、DragerEvita4/V300有创呼吸机、非利浦V60无创呼吸机、德国Weinmann转运呼吸机、德国Weinmann睡眠呼吸监测仪（包括便携式和多导睡眠监测仪）、危重监护仪器等。学科在诊治呼吸系统常见病如肺部感染、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、肺癌、肺动脉高压、肺心病、呼吸衰竭、气胸、咯血、胸腔积液、肺栓塞及睡眠呼吸障碍疾病等常见病方面积累了丰富的经验，对于一些呼吸系疑难杂症如危重肺部感染、肺结节病、肺曲菌病、隐源性机化性肺炎、弥漫性泛细支气管炎、过敏性肺泡炎及等少见病也有较丰富经验。科室医护人员常规开展经支气管镜针吸活检（TBNA）、经支气管镜肺活检（TBLB）、无痛电子支气管镜、CT引导下肺穿刺活检、DSA介入技术抢救大咯血，和相关科室合作开展经电子支气管镜介入治疗气道狭窄、支架植入等多种技术，使肺癌患者得到更好更有效的诊断和治疗，减轻患者痛苦。该学科在支气管哮喘、肺部感染、肺癌、睡眠呼吸障碍疾病等基础及临床研究成绩显著。近年来承担国家自然基金课题5项、省级课题3项，在国内外医学杂志上发表学术论文数100余篇，其中SCI期刊收录20余篇，主编和参编学术专著和教材3部。