常州市儿童医院小儿外科为常州市级临床重点专科，是常州地区最大的小儿外科疾病诊疗、科研、教学中心。科室设有固定床位46张，下设小儿普外、新生儿外科、小儿泌尿外科等专业。目前有医生14名，其中主任医师3名，副主任医师5名，有江苏省医学会小儿外科学会委员2名，常州市医学会小儿外科学会委员2名。其中博士1名，硕士研究生4名。在小儿普外和新生儿外科方面，先天性巨结肠、巨结肠同源性疾病的诊治经验丰富，常规开展新生儿巨结肠根治术、经肛门巨结肠根治术、短段型和超短段型的内括约肌部分切除术等，处省内先进水平，为省内外患儿服务。此外对先天性胆总管囊肿、胆道闭锁、新生儿消化道畸形、各种肿瘤及小儿外科各种疑难杂症方面均有丰富的经验，在全省处于较高水平。在小儿泌尿外科方面，先天性尿道下裂、先天性肾积水、肾盂输尿管各种畸形及肾母细胞瘤等疾病的诊治水平处于全省先进水平。先天性尿道下裂的一期成形术成功率达到省内先进水平。微创治疗已成为小儿外科的特色手术方式，2013年在常州地区首家施行小儿腹腔镜技术，开展的腹腔镜疝修补术、腹腔镜睾丸下降固定术、腹腔镜肠梗阻松解术等在常州市处领先地位，总手术例数目前已超过500例。多年来，小儿外科坚持不断创新，锐意进取，医、教、研、护等各方面都取得了长足的进步，其影响力覆盖面不断扩大，获得家长广泛好评，为广大儿童的健康做出了积极的贡献。优质护理服务该科是A类优质护理病房，将"以患儿为中心"的服务理念和人文关怀融入到对患儿的护理服务中，护士每日与患儿温情对话10分钟，开展测心率和抬臀运动等特色专科护理项目。