心电诊断科始建于2008年10月医院成立之初，集各项无创心电检查与诊断、教学于一体。科室人员配备：主任医师1名，副主任医师2名，主治医师5名，住院医师10名；其中具有硕士研究生学历8人，本科在读研究生5人。科室重视专业技能及综合素质的培养，定期举办科室讲座，不定期选送人员外出学习培训，不断学习心电学新技术新项目，提高业务诊断水平。开展项目包括：同步十二通道心电图、长程动态心电图及动态血压监测、长程动态心电及血压二合一检查等常规项目，经食道心房调搏术、次级量活动平板运动试验、全身大动脉弹性功能检查、立体心电向量检测、药物负荷试验等特殊检查项目。同时科室建立了完善的网络心电采集、报告系统，网络覆盖门诊、住院部及数十多个社区医院，实现心电数据实时传输与诊断。每年发表4-5篇论著。完成科研课题两项。科室连续七年举办国家级心电继教项目。曾获得全国优秀心电集体奖。科室每年承担安徽医科大学"心电诊断"教学工作，多所医学院校实习生及规培医生教学和基层人员进修带教任务。