感染病科是安徽省感染病学界的领头学科，省临床医学重点学科，省教育厅重点学科，省内最早的传染病专业硕士授予点和博士学位授予点，省感染病质控中心组长单位，国家药物临床试验专业点。科室现设有临床（病房、门诊）、免疫学实验室、分子生物学实验室、安徽省细菌耐药监控中心等部门,开设的床位数、年门诊量、年出院人数和危重病例抢救成功率均居省内各医院同专业之首。学科拥有一批高素质人才，博士生导师2人，硕士生导师8人,博士9人,主任医师10人,副主任医师9人。在国内具有一定的学术影响，其中国家级学术委员会委员5人，省级学术委员会主委2人，副主委5人，国家级期刊副主编1人，编委5人。主持国家自然科学基金项目10项、省厅级科研基金项目10余项。先后获得省（部）级科技进步奖一等奖1项、二等奖3项、三等奖2项，中华医学科技奖二等奖1项和三等奖1项。学科带头人李家斌主任系"新世纪百千万人才工程"国家级人选,享受国务院特殊津贴。科室设立有六个亚专科组：细菌性感染、病毒性肝炎、发热待查、人工肝脏、中枢神经系统感染、艾滋病。每组都有相应学科带头人开展了特色技术，包括：HBV-P基因区变异性检测、HBV和HCV基因型检测、细菌耐药性和耐药基因检测、肝穿刺病理学及免疫组化技术、人工肝支持治疗技术、罗氏高精度实时定量PCR技术(检测HBV,HCV,HIV)、国际标化乙肝五项定量检测技术、腹水浓缩回输技术、肝脏干细胞移植技术、射频消融技术、经皮肝穿胃冠状静脉介入栓塞术等。