阜阳市妇女儿童医院是国家卫生健康委妇幼司批准的先天性结构畸形定点医疗机构，阜阳市"明天计划"定点医疗单位，小儿外科是阜阳市临床重点专科，安徽省工人先锋号。科室现有副主任医师3名，主治医师1名，住院医师9名，担任安徽省医学会小儿外科学分会常务委员1人，阜阳市医学会小儿外科分会主委1人，副主委1人，以及专门从事小儿外科的优秀护理人员11名。均经国内知名医院儿外科专科学习、进修、培训。与上海儿童医院、安徽省儿童医院共建合作科室。小儿外科年出院人数2500人，年门诊量达2万余人，手术1700多台次，四类手术40%以上。腹腔镜微创手术及先天性结构畸形的救治是科室特色和强项，每年平均完成1000余例腹腔镜微创手术，；科室平均每年完成百余例消化系统、泌尿生殖系统、呼吸系统等先天性结构畸形手术。科室始终追踪当前小儿外科研究的最新动态和治疗理念，并尽最大努力将其应用到自身的医疗实践中来，广泛拓展业务的同时逐渐形成了自己的医疗特色。