心血管内科为阜阳市重点学科，与急诊医学科协作组建胸痛中心。现拥有三个病区，高级医师5名，开设床位100张，其中冠心病监护病区床位6张，带床边心电及血压监测。心内科配置有西门子心脏数字化造影机、心电监护仪、心电图机、心脏监护除颤仪、心电生理仪、心脏临时起博器等精尖设施。常规开展冠心病、先心病、心肌病、心律失常、高血压病等常见心血管疾病诊治，还开展各项心血管介入诊疗手术。心内科是阜阳市最早开展心脏介入治疗的科室，年开展心脏介入手术检查治疗千余例，主要可实施冠状动脉造影和PTCA+支架植入术、心内电生理检查、射频消融术根治快速心律失常、安装心脏起搏器治疗缓慢心律失常、心包穿刺置管引流治疗心包积液、先天性心脏病的封堵术。