北京中医医院眼科始建于1956年，是院级重点专科和北京市中医特色眼病诊疗中心。眼科创始人之一的名老中医丁化民是京城四大名医萧龙友的门人，丁老中医眼科造诣很深，誉满京城。现任眼科主任杨迎新是国际眼科科学院士王宁利教授的博士研究生，目前担任北京中医药学会眼科分会副主任委员，研究生导师。他在以往眼科主任王年梅、田月娥、付彦江等老专家们不懈努力的基础上，建立起眼科门诊病房一体化体系，目前医护团队成员20人，承担眼科的医教研工作；病房开放床位15张，科室拥有眼科照相，OCT，造影，电生理，视野，UBM等先进仪器。主要收治青光眼、玻璃体积血、黄斑病变、视神经病变等疑难眼病。眼科在中药内服、穴位贴敷、针灸、眼针、梅花针、雷火灸、耳穴压豆等中医特色疗法基础上，中西并重，能够独立开展外眼手术、青光眼手术、白内障手术、玻璃体腔注药术及玻璃体切割术等。眼科现有黄斑变性、眼肌麻痹、糖尿病视网膜病变、近视和白内障五个专病团队，以门诊中药、针灸为特色，以病房西药、手术为支持，取得满意的疗效。