血管外科专业于50年代初在省内早期开展血管外科疾病的诊治工作，2011医院成立血管外科，成为甘肃省首家独立建制的血管外科。现有大血管外科和周围血管外科两个亚专业。2016年获批中国微循环学会周围血管疾病专业委员会甘肃省规范化血管腔内治疗培训基地和甘肃省周围血管疾病诊疗中心，2017年成立中国微循环学会周围血管疾病专业委员会甘肃分会，任主委单位。学科目前展开床位40张，拥有高级职称4人，教授、副教授2人，硕生生导师2人，国外进修回国人员1人。多年来科室获得国家级奖1项（参与）、获得2项专利。发表核心期刊论文40余篇，主编专著7部，获得省部级基金项目10余项。培养硕士研究生8人。科室以"团结是基础、质量是生命、效益是动力、革新是出路"为科室发展指导方针，目前手术范围和种类已涵盖了血管外科的绝大多数手术，年手术台次1500余台，年介入手术500余台。多项技术填补了省内和院内空白。常规独立开展主动脉夹层微创手术、复杂主动脉病变的Chimney技术、体外开窗技术、原位开窗技术、腹主动脉瘤开放及支架腔内隔绝术、锁骨下动脉、颈动脉、肾动脉狭窄腔内及外科治疗、各种复杂的动脉闭塞性疾病的外科结合腔内介入治疗手术、下肢静脉曲张的个体化微创治疗、重症静脉血栓的诊治、各种复杂的糖尿病下肢血管病变、各种原因的中心静脉阻塞腔内治疗、透析通路建立及复杂透析通路并发症修复等。目前，学科在血管疾病的发病机制、病因诊断、血管病的预防及早期诊治方面均处于省内较高水平，尤其在微创治疗方面形成了鲜明的学科特色。