针灸推拿学学科由已故著名针灸学家郑魁山教授带领我院一大批老一辈针灸专家筹备创立，1990年经国务院学位委员会批准获得硕士学位授权资格，成为我院第一个具有硕士学位授权资格的学科。学科现为国家临床重点专科、国家中医药管理局重点学科、全国针灸临床中心甘肃分中心、高等院校特色优势专业、甘肃省针灸推拿临床医学中心、甘肃省重点中医药专科、甘肃省蜡疗中心、甘肃中医学院重点学科、甘肃省针灸临床研究基地，现有国家级名老中医工作室2个。学科下设针灸脑卒中康复科、针灸优势病种科、风湿骨病科、推拿康复科、针灸治疗科、针灸门诊部，现有床位106张。累计获得学科和专业建设经费1250余万元。