消毒供应中心是医院具备清洗、消毒、灭菌功能的核心科室，是再生器械和一次性无菌物品供应周转的物流中心。按"三甲"医院标准，新的消毒供应中心于2012年建成，并通过了江西省消毒供应中心评估验收。引进全市首台美国3M快速生物阅读器、德国合福医用封口机、山东新华蒸汽发生器、平移门脉动真空灭菌器、超声波清洗机、全自动医用器械干燥柜、520全自动清洗消毒机等设施设备。同时还引进了美国RuhofATP污染检测系统，并配备全程信息化质量管理追溯系统，以确保每一件无菌物品的安全性。