肾内科成立于1980年，为江西省医学领先学科，南昌大学医学院硕士授予点，国家药物临床试验机构成员，江西省小儿尿毒症免费救治定点医院，全省卫生系统医德医风示范科室，共青团江西省直属机关工作委员会青年文明号，中共江西省儿童医院委员会党员示范岗。该科为中华医学会儿科分会小儿肾脏病学组成员，中国医师协会儿科分会肾脏专委会成员，中国医师协会小儿血液净化专业委员会成员，参与全国小儿IgA肾病、溶血尿毒综合征、肾性血尿、小儿遗尿症、系统性红斑狼疮及狼疮性肾炎、慢性肾脏病等项目的协作研究或诊疗指南修订。科室目前开放病床92张，集临床、科研及教学为一体，现有主任医师3名、副主任医师5名；其中硕士研究生导师2名，博士1名，硕士13名，江西省卫生系统学术和技术带头人培养对象1名，医院优秀人才培养对象1名。近年来开展了10余项课题研究，其中国家自然科技基金1项，填补省内空白2项，国内先进水平2项，发表论文40余篇。学科技术力量雄厚，拥有先进的医疗设备，能以最前沿、科学的技术系统诊治各种小儿原发性、继发性或先天性肾脏疾病，开展的皮肤活检诊治小儿Alport综合征、小儿肾活检、基因测序等项目极大地提高了临床诊断水平；开展了小儿血管通路制作、血液透析、血液灌流、DNA免疫吸附、连续性血液净化等先进技术，能为不同年龄患儿的肾功能衰竭、急性中毒和免疫性疾病等进行安全、有效的血液净化治疗，曾成功救治一名11天的新生儿急性肾损伤3期患儿，技术达到国内领先水平；近年来开展的维持性血液透析及慢性肾脏病管理为尿毒症患儿重燃了生命的火花，学科综合水平居全省领先、全国先进。