神经外科创建于2016年，为省内唯一一家专业小儿神经外科，是中华医学会小儿神经外科学组创始组委员单位，中国小儿神经外科专家委员会创始组委员单位。该科有正高级职称医务人员一名，中级职称四名，硕士研究生三名，1名为江西省卫生系统学术和技术带头人培养对象。现有病床45张。该科主要治疗小儿颅脑外伤、脑积水、脑膜膨出、脊膜膨出、脊髓栓系综合征等先天性畸形、脑肿瘤、脑血管畸形、顽固性癫痫、头部血管瘤、皮样囊肿及各种头部包块等，尤其在重度颅脑损伤治疗方面有独特的见解，每年收治重度颅脑损伤患儿500例以上，其中特重度颅脑损伤合并单侧或双侧脑疝、呼吸不规则的患儿，经过血肿清除+去骨瓣减压手术等各方面治疗，效果良好，治愈率达到80%以上，后遗症较少，达到国内先进水平。重度脑积水患儿经手术等各方面综合治疗，可达到较满意的效果。微创治疗小儿凹陷性骨折，手术效果好，后遗症少，家属满意度高，省内外处于领先水平。该科先后承担、完成省厅级课题多项，如小儿创伤性蛛网膜下腔出血引起心肌损害的临床研究、小儿重度脑积水的手术治疗及综合评价分析、全省颅脑外伤小儿组的分析研究、增强尿激酶治疗小儿颅内血肿的临床分析、彩超多普勒超声诊断小儿脊髓栓系综合症的分析研究等，在省内外发表专业文章多篇，如小儿颅脑外伤的临床分析研究、小儿脑脓肿穿刺持续外引流的临床分析、增强尿激酶治疗小儿颅内血肿的临床分析、彩超多普勒超声诊断小儿脊髓栓系综合症的分析研究、小儿外伤性脑梗塞的诊断及治疗分析研究、小儿前囟皮样囊肿的手术治疗分析等。