性病科始建于20世纪50年代。1989年，南昌市卫生局批复该院成立"南昌市性病防治中心"，2010年转设为"性病科"。自成立以来，共诊治患者逾百万人次，成为省内技术权威、门诊规模大的性病专科，同时也是原国家卫生部规范化性病医疗服务门诊项目执行单位。性病科现有专职医师4名、护理人员3名，其中中、高级职称医师4名。科主任陶小华博士毕业于清华大学北京协和医学院，系德国慕尼黑大学皮肤病医院访问学者，南昌市高层次引进人才；叶发舜主任为南昌市名医。性病科设独立的性病门诊、专门的性病实验室。性病门诊日常开展梅毒、淋病，尖锐湿疣，生殖器疱疹，泌尿生殖道沙眼衣原体感染，前列腺炎，前列腺肥大，各类感染引起的宫颈炎和宫颈糜烂、阴道炎等各种急、慢性尿道炎以及其他各种性传播疾病，性病引起的性功能障碍等项目诊疗。尤其是通过腔道内光动力治疗仪治疗宫颈和肛门尖锐湿疣成为该院的一项特色。在开展性病诊疗的同时，性病科坚持以患者为中心，积极通过性病规范化治疗，防控艾滋病的传播，与社会各界携手共同推进"防艾"公益事业，发挥了积极作用。