医院专家门诊于2000年初正式组建，系为满足广大群众对中、重症和复杂性、疑难性皮肤病的诊疗需求和临床教学需要而设立，其专家团队由医院所聘副主任医师及以上的医生（副主任医师聘任满三年，经医院专家委员会考核确定）组成，专业涵盖皮肤内科、皮肤外科、皮肤中西医结合科、皮肤物理治疗、临床真菌学、临床病理学等方面，目前有主任医师（教授）8名，副主任医师（副教授）13名。目前，医院常设9个专家门诊诊察室，独立单间，一人一诊室。无假日服务，周末及节假日照常开诊。专家门诊组建近20年来，坚持"专注皮肤健康服务人民群众"的宗旨，累计服务患者逾百万人次，受到广大群众欢迎；同时，其专家团队也是全省皮肤病诊疗专家会诊的主要力量，并根据个人专长入组医院性病门诊、痤疮专病门诊、皮肤中医门诊和儿童皮肤病门诊等特色门诊诊疗团队，发挥着重要作用。此外，专家门诊也是医院对规培生、进修生、实习生带教的重要场所，为扬州大学、江西中医药大学等高校和基层医疗机构培养了大批皮肤病诊疗人才，充分体现了公立三甲医院的技术优势和社会公益特性。