内二科是以消化病和风湿免疫性疾病为主的综合性内科，设备齐全，是江西省中医药管理局重点建设专科；开设了慢性萎缩性胃炎、胃癌癌前病变、胃食管反流病、消化性溃疡、功能性消化不良、肠易激综合征、溃疡性结肠炎、胆囊炎/胆石症、各类肝炎及肝硬化、类风湿性关节炎、骨性关节炎、强直性脊柱炎、痛风等具有中医治疗优势特色的专病专科；开展了幽门螺杆菌检测、普通及无痛胃肠镜、内镜下放大染色技术、关节腔内注射；开展了内镜下粘膜切除术和剥离术、内镜下止血及风湿性疾病的生物疗法等治疗技术。科室开展近10项中医特色治疗如：脐灸、中药烫熨、穴位贴敷、耳穴埋豆、拔火罐等，疗效显著，得到患者的一致认可。科室共承担省市科研课题4项，长期承担江西中医药大学、井冈山大学医学院、江西中医药高等专科学校及赣州市卫生职业健康学院的实习带教工作。