功能科于1994年成立。由B超室1人、心电图室2人、脑电图室、胃镜室1人、经颅多普勒1人、碎石中心3人、乳透室1人组成。至2010年，该科有工作人员15人，其中副主任医师2人，主治医师1人，医师6人，护士6人。该科担负着全院的门诊、住院病人以及体检的全部功能辅助检查，为临床提供第一手诊断信息。胃镜室成立于1991年3月，成立之初有护士1人，兼职医师3人。配备奥林巴斯纤维胃镜一台，2001年初更换了更为先进的奥林巴斯电子内窥镜，主要开展胃肠道疾病诊治，到2010年医院胃镜室有医师1人，护士2人。该室下消化道疾病诊治填补了我市空白，并荣获了2006年瑞金市科技进步三等奖。