四川大学华西第二医院小儿肾脏专业创建于1987年，独立建科于2018年，是四川省医学会儿科学专业委员会肾脏病学组组长单位，系我国儿童肾脏疾病临床、教学和科研的重要基地之一。现有教授2人、副教授2人、主治医师3人；博士生导师1人，硕士生导师1人；多名医护人员曾赴美国哈佛医学院波士顿儿童医院、约翰.霍普金斯大学医学院、辛辛那提儿童医院等知名医院肾脏科学习。科室开放床位51张，开设儿童夜遗尿疾病专病门诊，年专科出院人数约2000人次，年专科门诊约5万人次，诊治范围包括原发性肾小球肾炎、各种继发性肾小球肾炎（如紫癜性肾炎、狼疮性肾炎、ANCA相关性血管炎、乙型肝炎病毒相关性肾炎）、肾病综合征、尿路感染、遗传性肾脏疾病、肾小管疾病、间质性疾病、溶血尿毒综合征、急性肾损伤、慢性肾脏病和儿童夜遗尿等。2001年开始开展儿童肾活检，现每年完成肾活检约300例。2005年开始开展儿童血液净化，拥有血液透析机3台、连续性血液净化装置4台和自动腹膜透析机1台，服务于新生儿至18岁患儿，为全院多个临床科室提供血液透析、腹膜透析、连续性血液净化、血浆置换、血液灌流、免疫吸附和胆红素吸附，每年血液净化3000余例次，培养来自全国各地儿童血液净化专科医护人员110余名。科室承担四川大学华西临床医学院本科、硕士、博士等多层次儿童肾脏疾病教学工作，每年招收小儿肾脏专业硕士和博士研究生2名；开展各类儿童肾脏疾病研究工作，科研重点方向是微小病变型肾病发病机制和急性肾损伤修复机制，承担多项国家自然科学基金和省部级科研项目。