肛肠科成立于1953年，是医院具有60余年历史的老科室，也是全国最早成立肛肠科的科室之一，具有良好的口碑。目前开放两个门诊诊断室，病房位于第二住院部2楼，设有中医特色治疗室、肛门压力测定室、熏蒸治疗室、特色换药室、教学室等。经过60余年的不懈努力与发展，已逐步成为一个集临床、科研、教学、预防为中心，集门诊、病房为一体的肛肠病专科。科室始终以病人为中心，以全心全意为广大病员服务为宗旨，不断发展，不断壮大。目前科室师资、技术力量强劲，拥有一支知名度较高、技术雄厚、知识全面的高素质团队，包括中华医学会评定的全国中医肛肠名专家、主任医师、教授1名，副主任医师2名，主治医师2名，住院医师4名，其中肛肠专业硕士5名。科室常规诊疗疾病为环状混合痔、高位复杂性肛瘘、肛周脓肿、高位直肠息肉、肛门畸形、直肠阴道瘘、直肠脱垂、肛门周围囊肿、便秘等。首创肛肠病无痛、低痛手术治疗，针对肛肠病术后剧烈疼痛，该科近十多年来，以现代医学技术为支撑，多层次、多途径开展围手术期无痛治疗技术，极大减轻或消除了患者术后疼痛。率先在成都地区开展痔疮疾病的微创手术——PPH术和TST术。科室成立便秘诊疗中心，专门研究肛门坠胀、慢性便秘等。