西部战区总医院神经外科是我国最早创建的神经外科之一，为全军脑肿瘤微创治疗中心，成都军区神经肿瘤研究所，也是全军神经外科专委会及中国医师协会四川省神经外科专委会副主任委员单位，为第三军医大学博士学位授权点，该科是一个以中青年科技人员为主、人才梯队和专业结构合理，医、教、研实力雄厚的学科；展开床位83张，病区2个，癫痫刀诊治中心1个，有国家自然科学基金实验室及高原颅脑火器伤实验室，拥有GE电磁导航，美国全数字网络化癫痫刀，齐佰林脑室镜，蔡司NC4、德国蛇牌等高端设备；擅长显微神经外科、脑立体定向与功能神经外科、顽固性癫痫的癫痫刀治疗、重型颅脑损伤救治，脑、脊髓肿瘤诊治以及脑血管疾病介入治疗等，治疗水平居于国内一流水平。近年来开展显微锁孔神经外科手术，经蝶入路切除颅底巨大肿瘤，脑干及高颈段肿瘤的切除，面肌痉挛MVD术，颈内动脉内膜剥离及颅内外搭桥术治疗缺血性疾病，先天性脑膜膨出治疗，颈动脉灌注化疗治疗脑恶性肿瘤，立体定向及超声导航技术深部病灶切除以及中药大黄有效组分治疗颅脑创伤等，更使该科室临床治疗水平上升了一个新台阶，尤其开展的立体定向脑内多靶点毁损加内放射粒子植入治疗精神疾病达到国际先进水平。