儿科成立于2009年12月，现已发展为设备先进、临床经验丰富的一支综合素质好、业务技术高且充满朝气的专业技术队伍。2021年5月，四川大学华西第二医院儿科知名专家陶于洪教授出任学科主任。科室现有医务人员31人（其中医学博士2人，硕士1人）。儿科设有门诊及住院。门诊开设普通儿科门诊、华西二院专家门诊、儿童夜遗尿门诊、儿童血管瘤门诊、儿童哮喘门诊等特色门诊。住院病区前期开放病床49张，总床位150张。科室现有儿童呼吸机、儿童肺功能仪、小儿脑电图机、呼出气一氧化氮检测仪、血气分析仪、脉搏氧饱和度仪、多参数心电监护仪、微电脑输液泵、快速血糖测定仪、双波长光纤激光治疗仪、振动排痰仪等先进的诊疗设备。开展各种儿童内科性疾病的诊断和治疗，对小儿川崎病、小儿慢性咳嗽、支气管肺炎、肺炎支原体肺炎、毛细支气管炎、重症肺炎合并呼吸衰竭、心力衰竭、支气管哮喘、热性惊厥、传染性单核细胞增多症等疾病的诊治有丰富的临床经验和较高的诊疗水平。科室近期发展目标为创建省级重点专科，远期目标为建成区域性儿童疾病救治中心，住院病区将开设四川大学华西第二医院血液肿瘤科延伸病房，还将建成开放床位20张的全市第一家PICU，极大提高本地区儿童重症救治水平。