医保办于2002年成立，作为医院职能科室，其主要职能是执行国家、省、市有关城镇职工、居民、新合医疗保险、医疗服务价格、异地医保、工伤生育保险及相关商业医疗保险的政策、规定和协议；做好自贡市城镇职工基本医疗保险（含伤残军人、离休干部）及补充医疗保险、新农合、居民医保、工伤生育险的各种业务办理工作；做好与相关部门、各医保经办机构的市场开发、协议签订、业务联系以及政策支持等协商、协调、协助检查等工作；做好医院各项医疗保险工作的宣传、具体实施以及监督管理工作；做好中心各类医保病种的申报和报账以及公务员补助和外出住院职工报账等工作。医保办成立以来，从单一的职工医保，到职工、居民、新合医保全覆盖，从市内部分区县到全市四区两县医保经办机构全定点，从市内医保发展到省外的医保定点医疗机构，医保病人从每月几十人次到每月六千余人次，医保科共有工作人员9名，包含临床护理职称人员3名，信息技术员3名，医保管理员3名，其中研究生3名，中共党员5名。医保病人费用从年100万左右增加到10亿，可见，医保办的发展见证了医院的发展，医保办为医院医保工作的顺利开展，为确保广大参保人员的待遇享受做了积极的工作。