消化内镜诊断治疗中心是一个全院科室共享的资源平台，中心拥有日本奥林巴斯电子内镜主机一套，富士电子内镜主机两套，电子胃镜、结肠镜、十二指肠镜共五条，奥林巴斯纤维十二指肠镜一条，奥林巴斯纤维小儿胃镜一条，同时拥有完备的消化内镜下治疗辅助设备。目前中心共有医生15名，其中主任医师3名、副主任医师4名、主治医生4名，硕士学位3人。主管护师2人，护师1人。内镜医师均有较丰富的诊治经验，开展内镜下诊治项目丰富、完善，是荆州地区设备较先进，技术力量较强的内镜中心之一，治疗项目包括食道胃底静脉曲张治疗，胃肠道息肉的切除，胃肠道肿瘤的内镜下治疗，胆总管结石的取石治疗。同时与武汉协和医院，武汉同济医院,武汉大学人民医院，广州中山大学附属第一医院等内镜中心有良好的协作关系。