武汉儿童医院自1986年开展儿童结肠镜检查，是全国较早开展儿童消化内镜的儿童专科医院。历经30多年的发展，现有主任医师3人，副主任医师3人，主治医师2人。每年可完成消化内镜检查以及消化内镜下治疗共计约5000人次，规模位居全国儿童专科医院前列。消化内镜中心设备完善，拥有电子胃十二指肠镜，电子结肠镜，双气囊小肠镜，超声内镜，放大色素内镜，内镜电外科工作站以及胃肠动力监测系统。可进行多种消化道疾病的内镜诊断并已开展多种内镜下治疗：包括消化道各种异物取出，消化道息肉切除，消化道病变的粘膜切除，上、下消化道狭窄扩张治疗，经皮胃造瘘术，消化道出血内镜下止血治疗等等。