上海儿童医学中心新生儿科始建于2000年，立足浦东新区，团队实习不断提升、影响力持续扩展，已成为上海主要的新生儿疾病诊治中心之一。2008年起成为"上海危重新生儿抢救中心"之一，担负区域内、上海并辐射周边省市的危重新生儿的转运和救治工作。2020年8月迁入新医疗科教综合楼，扩展为三个病区，包括新生儿重症监护室（NICU），普通新生儿病房和家庭式病房，核定床位116张。从产房复苏、院前转运、危重救治和出院前家长参与的家庭护理指导，为包括早产儿在内的高危新生儿提供一体化诊疗。此外，团队注重高危新生儿随访，开设高危儿随访门诊、高危新生儿免疫接种门诊，为早产儿、危重新生儿提供出院后持续随访服务。科室拥有一支临床经验丰富的医护队伍，现有专科医师22名、护士66名。专科医师中主任医师3名，副主任医师1名，博士7名，硕士14名，现有硕士研究生导师2名。近年来先后承担多项国家自然科学基金课题以及各类省部级研究课题，研究领域覆盖新生儿营养、早产儿养育环境的影响、心脏和肺的组织学发育的机制研究，研究成果曾获上海医学科技奖和上海市科技进步奖二等奖。作为首批国家级围产新生儿专科培训基地，多年以来培训来自全国各地的专科进修医护人员百余名。科室配备各类新生儿暖箱和开放式辐射抢救床数十台，每床均配置全套监护设备，开展床旁摄片、超声、振幅整合脑电图、心功能等无创检查。NICU床位均配备无创或常频、高频新生儿呼吸机，为成功救治危重新生儿提供了保障。每年收治各种危重新生儿约2400例，病种涵盖新生儿危重疑难病例、早产儿和先天性疾病和畸形等。科室开展新生儿全系列呼吸支持、肠内外营养支持、ECMO、CRRT、亚低温治疗、有创动脉监测、腹膜透析等技术，抢救成功率达98%以上。成功救治早产儿最小胎龄23周，最低出生体重545克。科室依托医院优势学科开展各类先天畸形新生儿的围术期监护和治疗，尤其在危重复杂新生儿先心病的多学科合作救治上具有特色；依托转化医学研究所开展新生儿疑难病例的基因诊断；常规开展深静脉置管、PICC置管、脐静脉置管、外周动静脉同步换血、发展性护理、新生儿抚触和经口喂养训练等技术，科室综合实力达到国内先进水平。